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O objetivo desta pesquisa é verificar se existe relação entre o desempenho operacional e as fontes de financiamento das organizações sem fins lucrativos. Para isto foram analisadas 58 entidades portadoras do Título de Utilidade Pública Federal (UPF) dos estados do Rio Grande do Norte e Paraíba. Foram utilizadas duas técnicas estatísticas para a análise empírica dos resultados: regressão com dados em painel e efeitos fixos e regressão quantílica. A hipótese de que as organizações que são mais dependentes de recursos públicos apresentam maior desempenho foi aceita, visto que estas organizações são obrigadas a prestarem contas dos recursos auferidos, bem como de atingir os objetivos e metas constantes nos contratos de parceria efetuados com os órgãos convenentes. Os resultados foram semelhantes para as técnicas utilizadas, no entanto a regressão quantílica permitiu analisar a associação entre a variável resposta (desempenho operacional) e as variáveis explicativas (modelo de financiamento) nos diversos quantis da distribuição condicional. Os resultados da pesquisa não podem ser generalizados, visto que se faz necessário uma amostra maior bem como o uso de outras técnicas que corroborem os resultados. No entanto, os resultados contribuem para a discussão acerca do papel das organizações do terceiro setor como coparceiras dos demais setores da sociedade, bem como do papel dos agentes financiadores como incentivadores das organizações em alocar eficientemente os recursos aportados, a prestação de contas e a credibilidade das informações publicadas à sociedade.